1.  將基質裝入柜(箱)內(容積1～2立方),通入蒸汽進行密閉消毒。一般在70～90℃條件下，消毒半小時至一小時，就能殺死病菌。注意每次消毒的基質不可過多，否則處于內部的基質中的病菌或蟲卵不能完全殺滅；消毒時基質的含水量應控制在35%～45%，過濕或過干都可能降低消毒效果。

2. 甲醛是良好的殺菌劑，但殺蟲效果較差。一般將40%的原液稀釋50倍，用噴壺將基質均勻噴濕，所需藥液量一般為20～40L/m3基質。最后用塑料薄膜覆蓋封閉24～48小時后揭膜，將基質攤開，風干2周或暴曬2天后，達到基質中無甲醛氣味后方可使用。要求工作人員戴上口罩，做好防護工作。

3.  高錳酸鉀是強氧化劑，一般用在石礫、粗沙等沒有吸能力且較容易用清水沖洗干凈的惰性基質上消毒，而不能用于泥炭、木屑、巖棉、陶粒等有較大吸附能力的活性基質或者難以用清水沖洗干凈的基質，因為這些基質會吸附高錳酸鉀，會直接毒害作物，或造成植物的錳中毒。基質消毒時，用0.1%～1.0%的高錳酸鉀溶液噴灑在固體基質上，并與基質混拌均勻，然后用塑料包埋基質20～30分鐘后，用清水沖洗干凈即可。

4.  漂白劑包括漂白粉或次氯酸鈉，尤其適于礫石、沙子消毒。施用方法是在水池中制成0.3%～1.0%的藥液(有效氯含量)，浸泡基質半小時以上，然后用清水沖洗，以消除殘留氯。一般要求不要用于具有較強吸附能力或難以用清水沖洗干凈的基質上。